24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3519 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 262 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  42.96 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  33.72 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  33.72 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  33.72 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  37.97 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  54.55 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  55.93 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  34.32 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  62.5 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  31.42 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  31.06 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  51.06 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  52.54 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  50.88 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  46.43 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  53.33 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  51.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  34.04 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  28.76 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  55.56 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3509  putative transmembrane anti-sigma factor  46.43 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  32.26 
 
 		 259 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>