More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3434 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
425 aa  807    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  45.26 
 
 
441 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  43.51 
 
 
440 aa  279  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  43.44 
 
 
502 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  42.92 
 
 
428 aa  252  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  47.87 
 
 
441 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  41.81 
 
 
474 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  44.26 
 
 
450 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  53.58 
 
 
540 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  36.98 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  36.05 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
440 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  33.04 
 
 
477 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  37.1 
 
 
468 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 
435 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  34.86 
 
 
430 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 
445 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 
455 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  35.08 
 
 
456 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 
440 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  35.24 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 
448 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  34.77 
 
 
455 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 
473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 
438 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  30.44 
 
 
501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
473 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 
458 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  34.78 
 
 
434 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  32.73 
 
 
465 aa  132  9e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  26.39 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  35.09 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  30.31 
 
 
418 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  32.33 
 
 
476 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
432 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
432 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
434 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
434 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
434 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
434 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
434 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.66 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  29.71 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  29.36 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  26.82 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  35.42 
 
 
456 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  29.43 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 
432 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  27.52 
 
 
436 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  28.9 
 
 
425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  28.13 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  31.91 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 
416 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  28.37 
 
 
418 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  28.37 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  27.51 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  27.51 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  28.37 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  28.37 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  33.69 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  28.37 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  26.85 
 
 
438 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  28.29 
 
 
432 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  28 
 
 
429 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  28.29 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  29.38 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 
416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  28.34 
 
 
416 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 
446 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 
416 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  27.57 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  26.82 
 
 
443 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  27.89 
 
 
434 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  28.29 
 
 
428 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  28.15 
 
 
416 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  27.81 
 
 
416 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>