245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11970 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  74.84 
 
 		 460 aa  658    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 458 aa  894    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  67.11 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  57.33 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.65 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.09 
 
 		 476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  36.08 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  36.74 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.74 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.74 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.07 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.3 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.46 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.95 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.3 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.3 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.87 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.3 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  37.08 
 
 		 431 aa  246  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  35.35 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.6 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.17 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.89 
 
 		 475 aa  242  9e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  34.91 
 
 		 502 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  37.55 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.57 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  36.03 
 
 		 448 aa  236  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.73 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.36 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  33.18 
 
 		 431 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  35.5 
 
 		 457 aa  233  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  34.28 
 
 		 454 aa  233  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.08 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.95 
 
 		 458 aa  229  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  35.19 
 
 		 446 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.39 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  31.73 
 
 		 454 aa  226  8e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  34.31 
 
 		 447 aa  226  9e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 497 aa  226  9e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  33.7 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.4 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  33.55 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  31.48 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  31.48 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  31.48 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  32.39 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  30.94 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  32.83 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.4 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  32.96 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 484 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  32.46 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.62 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.93 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  29.98 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.02 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  32.2 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  31.07 
 
 		 457 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  33.11 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 		 447 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.52 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.52 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  34.15 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.3 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  33.99 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  31.19 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  32.37 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  32.55 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  32.96 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.3 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.08 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  31.03 
 
 		 461 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  33.85 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  33.85 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.26 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  33.63 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  35.45 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  31.4 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  35.45 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  32.66 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  35.62 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>