More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11550 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  74.67 
 
 		 150 aa  228  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  69.54 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  65.33 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  55.49 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  62.67 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  56.08 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  43.31 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  35.33 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  37.67 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  39.73 
 
 		 187 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  38.89 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  39.34 
 
 		 173 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  39.34 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  42.86 
 
 		 188 aa  90.9  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  33.13 
 
 		 159 aa  90.5  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  39.34 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  35.57 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  41.6 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  38 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  40.68 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  32.48 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  32.48 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 185 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  36.75 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 185 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  33.57 
 
 		 188 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 184 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 178 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 175 aa  83.6  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  36.51 
 
 		 209 aa  83.6  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  32 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  32 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  31.97 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  36.77 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  29.87 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  32.47 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  33.97 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.34 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.21 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  32.88 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20180  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0170595  normal  0.0624754 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  32.28 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  36.67 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  39.01 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  32 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  30.67 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  34.69 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  31.29 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  31.29 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  30.14 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  42 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  32.47 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>