More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06850 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  68.18 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  67.89 
 
 		 252 aa  290  9e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  51.77 
 
 		 514 aa  197  7.999999999999999e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  47.53 
 
 		 232 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.27 
 
 		 534 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.61 
 
 		 511 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  51.64 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.61 
 
 		 511 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  51.18 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  48.87 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  48.64 
 
 		 229 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  49.53 
 
 		 229 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.79 
 
 		 528 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  46.76 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.73 
 
 		 539 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.08 
 
 		 529 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  49.77 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  51.58 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  46.76 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.33 
 
 		 516 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.8 
 
 		 526 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.4 
 
 		 527 aa  181  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  49.29 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.93 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.33 
 
 		 516 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  45 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  49.77 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  50.88 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  45 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  45 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.06 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  48.4 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.85 
 
 		 488 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  48.87 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  48.87 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  48.87 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  42.53 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  48.2 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  43.44 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  49.78 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.2 
 
 		 517 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  47.51 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  48.4 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.84 
 
 		 510 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  48.86 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  48.4 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>