More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0978 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  43.61 
 
 
2682 aa  747    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  47.97 
 
 
2684 aa  852    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.97 
 
 
6889 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.19 
 
 
1337 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 
1582 aa  1152    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  37.55 
 
 
1497 aa  852    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.74 
 
 
3133 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  33.09 
 
 
3427 aa  673    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  38.37 
 
 
2316 aa  916    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  45.96 
 
 
4186 aa  786    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  55.87 
 
 
1424 aa  1050    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
2551 aa  842    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
1874 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.06 
 
 
1656 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  38.74 
 
 
1833 aa  1174    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.66 
 
 
1587 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  52.98 
 
 
1646 aa  974    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  35.54 
 
 
1416 aa  824    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  44.52 
 
 
2454 aa  779    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  30.9 
 
 
1530 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  44.1 
 
 
2710 aa  814    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.94 
 
 
4239 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  45.39 
 
 
2273 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  42.94 
 
 
1520 aa  1134    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  41.52 
 
 
3194 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  45.01 
 
 
1574 aa  1239    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  43.94 
 
 
3090 aa  1119    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  31.9 
 
 
1524 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  42.02 
 
 
2462 aa  695    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  48.4 
 
 
2498 aa  879    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  49.24 
 
 
995 aa  899    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  44.2 
 
 
4646 aa  1135    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  42.92 
 
 
1466 aa  905    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.55 
 
 
1559 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  40.42 
 
 
1560 aa  986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 
2150 aa  1107    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  38.86 
 
 
1488 aa  729    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  42.9 
 
 
1472 aa  734    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  44.34 
 
 
3108 aa  1124    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.97 
 
 
2762 aa  752    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  49.94 
 
 
1408 aa  912    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  32.36 
 
 
2226 aa  694    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  40.73 
 
 
1612 aa  1031    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  45.37 
 
 
2679 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  40.22 
 
 
2551 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  47.67 
 
 
1909 aa  902    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.73 
 
 
1354 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  50.29 
 
 
1000 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  45.23 
 
 
2604 aa  791    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.26 
 
 
1087 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  46.59 
 
 
2176 aa  813    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  34.45 
 
 
3099 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  35.93 
 
 
2093 aa  1031    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  42.9 
 
 
1472 aa  734    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  44.18 
 
 
3089 aa  1119    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  40.73 
 
 
1612 aa  1031    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  42.94 
 
 
1911 aa  1018    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1489 aa  746    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  43.31 
 
 
1470 aa  747    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  48.6 
 
 
1302 aa  907    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 
4647 aa  967    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  38.31 
 
 
1486 aa  884    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 
1466 aa  752    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  40.23 
 
 
1535 aa  1075    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  49.24 
 
 
995 aa  899    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.74 
 
 
3127 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  46.14 
 
 
3335 aa  789    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.76 
 
 
1559 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  43.53 
 
 
974 aa  755    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  30.87 
 
 
1530 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  31.09 
 
 
1528 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  33.14 
 
 
2243 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  45.05 
 
 
4265 aa  734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 
1472 aa  737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1653 aa  3419    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  44.5 
 
 
3093 aa  1124    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  43.73 
 
 
3130 aa  1126    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  45.05 
 
 
4265 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  41.26 
 
 
1795 aa  1217    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.73 
 
 
3173 aa  635  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  39.35 
 
 
3163 aa  626  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 
1465 aa  623  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.6 
 
 
1349 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.49 
 
 
1349 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  37.99 
 
 
3337 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.38 
 
 
3693 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.38 
 
 
3693 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.27 
 
 
3702 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.85 
 
 
4478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.57 
 
 
3676 aa  606  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 
3679 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.55 
 
 
3696 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  48.07 
 
 
926 aa  595  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 
3275 aa  596  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.9 
 
 
2792 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  33.48 
 
 
1658 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  56.29 
 
 
3235 aa  590  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  38.16 
 
 
1402 aa  592  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.71 
 
 
3176 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 
3092 aa  588  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>