More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5459 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  77.17 
 
 		 201 aa  283  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  67.96 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  65.75 
 
 		 186 aa  248  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  47.75 
 
 		 199 aa  164  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  52.98 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  52.98 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  49.47 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  47.75 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  44.62 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  47.8 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  46.56 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.03 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  55.56 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  49.7 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  51.35 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  53.1 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  44.62 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  54.97 
 
 		 293 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  47.51 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  56.52 
 
 		 326 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  54.97 
 
 		 294 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  54.97 
 
 		 294 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  53.64 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  55.07 
 
 		 298 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  48.9 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  44.09 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  42.46 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.36 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  49.45 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  53.64 
 
 		 293 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.72 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  45.56 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  45.56 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  45.56 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  44.26 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  52.14 
 
 		 309 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  44.26 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  46.89 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  45.7 
 
 		 193 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  43.72 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 307 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 307 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  42.93 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  45.65 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 		 183 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  50 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  44.09 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  42.08 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  54.33 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  44.81 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  44.81 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  47.28 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  55.22 
 
 		 305 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  43.17 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  43.17 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  52.17 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  44.44 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  51.95 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  51.95 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  45.03 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  41.53 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  41.62 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  41.53 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  41.53 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  52.42 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.44 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  41.27 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  50 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  50 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  50 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  46.81 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  47.26 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  39.78 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  39.78 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0718  resolvase domain-containing protein  48.59 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.784479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  45.64 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.59 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  40.84 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  42.02 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>