35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1114 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  36.23 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  33.83 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.38 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.43 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.43 
 
 
205 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  35.14 
 
 
194 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  32.28 
 
 
203 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.86 
 
 
212 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  30.2 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  37.39 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  28.77 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.48 
 
 
213 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  28.48 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  27.56 
 
 
188 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  36.36 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  30.97 
 
 
212 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  47.92 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  47.92 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  52.17 
 
 
190 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  33.75 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  31.71 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  30.53 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  38.98 
 
 
390 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  30.09 
 
 
218 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  42.62 
 
 
392 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  51.35 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  30.72 
 
 
193 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  30 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  29.66 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1362  EF hand domain-containing protein  39.71 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  37.5 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  37.29 
 
 
390 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01720  calcium-binding EF-hand protein  37.35 
 
 
92 aa  40.8  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>