69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0247 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4738  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.88 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3661  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.88 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.305414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.45 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.82 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.87 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.68 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.63 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  25.88 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2678  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.63 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.47 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  26.16 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  25.42 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.26 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.37 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.41 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.88 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.42 
 
 		 394 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.58 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.58 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.12 
 
 		 394 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.07 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.68 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.67 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  31.53 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.97 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.76 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.74 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.53 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.47 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  24.83 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.86 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.06 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.15 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.15 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  25.43 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.07 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.19 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.95 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.84 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00150  Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)  25.82 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.62 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.48 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  22.7 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.86 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.66 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.56 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  25.93 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46716  predicted protein  21.79 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.45 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.03 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  28.21 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  27.03 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  27.03 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.66 
 
 		 230 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  27.03 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.03 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  27.03 
 
 		 306 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>