56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0296 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  100 
 
 
451 aa  907    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  70.81 
 
 
452 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  69 
 
 
454 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  64.55 
 
 
458 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  65.91 
 
 
445 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  62.87 
 
 
446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  64.92 
 
 
453 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  65.17 
 
 
455 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  63.86 
 
 
434 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  64.49 
 
 
447 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  63.96 
 
 
435 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  56.82 
 
 
452 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  56.44 
 
 
452 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  54.77 
 
 
446 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  52.81 
 
 
452 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  54.32 
 
 
446 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  54.9 
 
 
453 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  51.7 
 
 
450 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  34.68 
 
 
439 aa  229  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  32.96 
 
 
438 aa  223  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  32.73 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  32.51 
 
 
438 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  33.26 
 
 
439 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  32.41 
 
 
430 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  35.07 
 
 
443 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  30.07 
 
 
441 aa  196  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  29.98 
 
 
430 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  34.16 
 
 
453 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  34.55 
 
 
449 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.93 
 
 
437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.59 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  32.59 
 
 
449 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  30.16 
 
 
437 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  31.33 
 
 
467 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  32.16 
 
 
437 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  31.03 
 
 
428 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  29.78 
 
 
424 aa  143  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  30.68 
 
 
429 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.89 
 
 
455 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  30.04 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  29.01 
 
 
418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  29.01 
 
 
418 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  32.42 
 
 
456 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  29.6 
 
 
440 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  25.06 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  46.77 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
370 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  32.39 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  32.39 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  30.14 
 
 
449 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  45.16 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0500  aspartate dehydrogenase  32.17 
 
 
252 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431353  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  28.77 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>