More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1634 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1634  CBS  100 
 
 		 457 aa  949    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  67.18 
 
 		 457 aa  615  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  63.89 
 
 		 457 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  63.86 
 
 		 459 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  58.86 
 
 		 459 aa  584  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  57.33 
 
 		 457 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  54.7 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  32.59 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  33.85 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.18 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.07 
 
 		 459 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  29.48 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.63 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.44 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  29.66 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  32.09 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  32.25 
 
 		 455 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  38.32 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  30.02 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.5 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  31.66 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  31.22 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  31.22 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  31 
 
 		 464 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  31.24 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  31.2 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  31.29 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  31.6 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  31.77 
 
 		 458 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  31.57 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  30.84 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  32.55 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  31.47 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  31.65 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  30.8 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  32.1 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  31.13 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  31.84 
 
 		 459 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  30.41 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  30.75 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  31.59 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  30.72 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  31.09 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  32.6 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  30.4 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  32.38 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  31.03 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  31.43 
 
 		 455 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  36.61 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  29.66 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.09 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  30.44 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  29.79 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  31.65 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.3 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  29.61 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  30.79 
 
 		 465 aa  199  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.86 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  30.29 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.84 
 
 		 326 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  30.96 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.91 
 
 		 326 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.65 
 
 		 456 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  31.97 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  27.89 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.72 
 
 		 346 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.91 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  28.51 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.92 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  30.65 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  29.42 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.92 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.69 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  31.75 
 
 		 316 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  32.36 
 
 		 324 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  31.83 
 
 		 340 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  31.75 
 
 		 316 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  31.4 
 
 		 521 aa  170  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  33.22 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  31.72 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  31.29 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  31.29 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  30 
 
 		 324 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  30.74 
 
 		 324 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  33.44 
 
 		 344 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  30.97 
 
 		 324 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.97 
 
 		 325 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  30.97 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  31.6 
 
 		 345 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  32.05 
 
 		 346 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  31.72 
 
 		 326 aa  163  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  30.74 
 
 		 334 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  33.55 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  27.9 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.71 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  31.83 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  32.68 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  31.83 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  33.02 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  31.8 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>