More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5673 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  61.21 
 
 
262 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  58.25 
 
 
278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  59.01 
 
 
265 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  57.84 
 
 
276 aa  317  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  59.79 
 
 
293 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  59.15 
 
 
266 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  57.8 
 
 
276 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  57.24 
 
 
282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  57.2 
 
 
283 aa  300  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  57.25 
 
 
362 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  55.82 
 
 
286 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  57.35 
 
 
274 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  57.88 
 
 
316 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  55.86 
 
 
299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  57.61 
 
 
269 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  56.72 
 
 
268 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  52.69 
 
 
284 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  54.98 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  50.35 
 
 
269 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  54.51 
 
 
277 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  48.1 
 
 
300 aa  258  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.48 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.98 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.46 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.1 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.84 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.84 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.26 
 
 
230 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.98 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.89 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
249 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.17 
 
 
235 aa  62.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.88 
 
 
234 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.6 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.94 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.71 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 
231 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
260 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
231 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 
266 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  24.28 
 
 
251 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  29 
 
 
252 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.56 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.9 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  24.6 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5258  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0535  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.88 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.77555  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  35.56 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  28.31 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
237 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 
233 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.92 
 
 
230 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  26.5 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.09 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  25.81 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.93 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
249 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  26.5 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  26.5 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
247 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 
246 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
225 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
225 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.52 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
241 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  25.81 
 
 
260 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.53 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  35.25 
 
 
272 aa  55.8  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.35 
 
 
229 aa  55.8  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
222 aa  55.8  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.5 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.81 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.07 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.24 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0278  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.31 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.831577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0582  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.64 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6097  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.16 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0254883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.81 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.74 
 
 
238 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
223 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>