287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5455 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
322 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  62.21 
 
 
308 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  63.11 
 
 
312 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  58.88 
 
 
308 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  53.07 
 
 
331 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  53.23 
 
 
337 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  44.16 
 
 
310 aa  243  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  37.91 
 
 
302 aa  178  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
318 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  41.53 
 
 
301 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  37.83 
 
 
304 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  32.71 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
308 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  32.33 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 
321 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 
318 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  31.95 
 
 
326 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  31.95 
 
 
323 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  32.33 
 
 
323 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  32.67 
 
 
309 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  31.95 
 
 
323 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  31.95 
 
 
323 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  31.95 
 
 
326 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  36.51 
 
 
308 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
307 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  36.69 
 
 
310 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  38.13 
 
 
307 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 
306 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  37.26 
 
 
308 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  34.57 
 
 
316 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
305 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  37.36 
 
 
325 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 
328 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.14 
 
 
316 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.16 
 
 
312 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  38.89 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 
291 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  35.82 
 
 
318 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  30.41 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
310 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  39.07 
 
 
306 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
333 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  30.16 
 
 
307 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  31.91 
 
 
327 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  38.8 
 
 
318 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 
318 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 
318 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 
264 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 
307 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
296 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
266 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
305 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 
266 aa  96.7  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 
259 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  32.11 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
293 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  28.41 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  33.14 
 
 
241 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  48.05 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  36.29 
 
 
299 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  30.94 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
285 aa  59.3  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  21.9 
 
 
226 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 
239 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  22.43 
 
 
228 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.58 
 
 
329 aa  55.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  24.55 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  27.95 
 
 
582 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  29.9 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
231 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  22.41 
 
 
245 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
299 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 
282 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  27.67 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>