More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4726 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  100 
 
 		 443 aa  871    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  65.83 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  67.13 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  63.74 
 
 		 435 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  60.36 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  62.33 
 
 		 450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  58.81 
 
 		 455 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  56.82 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  59.67 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  58.49 
 
 		 447 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  59.41 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  55.78 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  57.11 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  58.86 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  59 
 
 		 453 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  56.03 
 
 		 480 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  47.93 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  56.87 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  62.37 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  45.58 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  45.07 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  41.2 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  43.98 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  36.14 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  40.7 
 
 		 449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  36.14 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  36.14 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  36.14 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  36.51 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  36.05 
 
 		 453 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  36.28 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  36.05 
 
 		 453 aa  299  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  35.83 
 
 		 453 aa  298  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  35.83 
 
 		 453 aa  298  9e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  35.83 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  40.36 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  37.82 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 		 454 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  35.15 
 
 		 458 aa  276  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  34.26 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  42.32 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  42.82 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.16 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.47 
 
 		 494 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  44.07 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  40.44 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.86 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.34 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.78 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  30.47 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.57 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  34.45 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.81 
 
 		 454 aa  179  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.19 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  34.32 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  33.57 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  32.78 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  31.28 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  32.23 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  31.84 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  30.82 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.7 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.7 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  31.8 
 
 		 449 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  34.32 
 
 		 445 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.63 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.95 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.26 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  32.36 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  31.28 
 
 		 470 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.34 
 
 		 442 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  36.26 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.25 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  31.45 
 
 		 440 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.49 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  31.81 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  34.61 
 
 		 459 aa  169  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  29.79 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.4 
 
 		 467 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  29.79 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  32.03 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.47 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.78 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  32.12 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  31.38 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  31.14 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  27.08 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  29.79 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  31.59 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  31.45 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  30.75 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  31.39 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  31.15 
 
 		 437 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  31.39 
 
 		 475 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  31.39 
 
 		 475 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.11 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.94 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.82 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  30.28 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  35.4 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>