More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3686 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
326 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  64.84 
 
 
441 aa  346  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  56.33 
 
 
425 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  53.31 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  54.07 
 
 
496 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  54.81 
 
 
389 aa  256  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  49.33 
 
 
410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  51.11 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  56.65 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  52.81 
 
 
460 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  47.32 
 
 
435 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 
412 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  55.7 
 
 
415 aa  242  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  54.29 
 
 
266 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  55.22 
 
 
424 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  51.23 
 
 
416 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  56.19 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 
437 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  50.2 
 
 
421 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  50.2 
 
 
421 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  50.2 
 
 
421 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  51.61 
 
 
333 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  52.61 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  42.57 
 
 
422 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  46.05 
 
 
238 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  37.23 
 
 
574 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  36.79 
 
 
238 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
239 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
238 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 
238 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
606 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.07 
 
 
259 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
613 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
255 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  38.25 
 
 
243 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  31.97 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
256 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
256 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  32.17 
 
 
325 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
267 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
256 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
238 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
245 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
273 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
380 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
237 aa  99.4  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
236 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
243 aa  95.9  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.7 
 
 
780 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
232 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.79 
 
 
247 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
289 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  36.59 
 
 
285 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.76 
 
 
246 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
246 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.21 
 
 
248 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
241 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  31.64 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  27.78 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.1 
 
 
410 aa  82.4  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.33 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.6 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  32.14 
 
 
883 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.21 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.29 
 
 
410 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  30.99 
 
 
244 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
267 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.36 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  30.22 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.1 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.16 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
235 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  31.22 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  28.1 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_002950  PG0920  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.33 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.635493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>