More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1454 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1454  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 345 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  50.58 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4924  Monosaccharide-transporting ATPase  54.78 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.39 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  46.53 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6918  Monosaccharide-transporting ATPase  47.46 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182781  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2371  sugar ABC transporter, permease protein  46.22 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474719  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1077  carbohydrate ABC transporter permease  46.22 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255506  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1608  sugar ABC transporter, permease protein  45.48 
 
 		 341 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.22 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0639  sugar ABC transporter, permease protein  46.22 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0827  carbohydrate ABC transporter permease  46.22 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1791  carbohydrate ABC transporter permease  46.22 
 
 		 350 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.23 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.4 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.72 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.64 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.75 
 
 		 336 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.6 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  29.12 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.84 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.54 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.56 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.75 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  29.65 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  30.72 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.54 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.54 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  33.54 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.6 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  30.53 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  28.94 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  32.44 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.04 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.88 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.88 
 
 		 358 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.55 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  33.96 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  30.88 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.9 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  30.93 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  31.86 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  32.76 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.32 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.77 
 
 		 309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  30.95 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  29.48 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  29.48 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  29.2 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  31.53 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  29.97 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  31.38 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  30.72 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  31.34 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.35 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  32.22 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 314 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  31.97 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.02 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  30.09 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  33.92 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  32.55 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  30.12 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>