217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1120 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
354 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  70.34 
 
 
353 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40 
 
 
330 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  39.8 
 
 
327 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  45.83 
 
 
369 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.48 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.25 
 
 
347 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  33.33 
 
 
331 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  34.59 
 
 
332 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  33.1 
 
 
347 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  33.68 
 
 
348 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.09 
 
 
364 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  35.68 
 
 
372 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  34.91 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  34.12 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  32.49 
 
 
348 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  33.09 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  33.73 
 
 
379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  34.36 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  33.73 
 
 
372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  32.49 
 
 
364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  33.77 
 
 
369 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  33.77 
 
 
369 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  33.77 
 
 
368 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.44 
 
 
347 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  33.19 
 
 
367 aa  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  30.28 
 
 
351 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  30.28 
 
 
351 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  32.74 
 
 
342 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  27.4 
 
 
328 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  27.4 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  30.62 
 
 
341 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  26.94 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.49 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  29.43 
 
 
334 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  37.18 
 
 
414 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.82 
 
 
361 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  31.91 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.47 
 
 
521 aa  89.7  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  26.55 
 
 
489 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.84 
 
 
362 aa  87  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.91 
 
 
418 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.3 
 
 
505 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.6 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  32.37 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  28.46 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  32.41 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.03 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  30.56 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  30.56 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  33.01 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  33.01 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  23.61 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.64 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  24.29 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.7 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  24.1 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  31.55 
 
 
302 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  24.44 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  29.15 
 
 
359 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.25 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  26.8 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  30.97 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  35.19 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  34.02 
 
 
334 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  28.69 
 
 
339 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.67 
 
 
343 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.59 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  21.33 
 
 
379 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  24.31 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.65 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  29.9 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  28.32 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  34.48 
 
 
756 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.09 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.942326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  30.61 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.05 
 
 
627 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  33.1 
 
 
741 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  33.1 
 
 
741 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.01 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.77 
 
 
621 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6734  ATPase  37.5 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140161  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  33.79 
 
 
741 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.46 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.93 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  30.08 
 
 
422 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  30.93 
 
 
343 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  33.33 
 
 
312 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.25 
 
 
628 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  24.05 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.25 
 
 
628 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  33.33 
 
 
742 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  29.25 
 
 
628 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  30.6 
 
 
633 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.25 
 
 
649 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.08 
 
 
621 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  30.93 
 
 
340 aa  46.2  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  34.09 
 
 
729 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.85 
 
 
628 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>