More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1896 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  100 
 
 
340 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  64.01 
 
 
342 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  60.83 
 
 
338 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  60.54 
 
 
339 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.05 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  59.94 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  58.63 
 
 
339 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.68 
 
 
343 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  56.59 
 
 
339 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  56.68 
 
 
343 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.68 
 
 
343 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  57.36 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  57.14 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.96 
 
 
345 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  56.97 
 
 
343 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  58.16 
 
 
339 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  56.89 
 
 
339 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.33 
 
 
343 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  55.95 
 
 
339 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  56.76 
 
 
334 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  31.73 
 
 
310 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.03 
 
 
360 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  34.21 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  31.67 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  31.61 
 
 
325 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  34.21 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.11 
 
 
378 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.33 
 
 
305 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  31.66 
 
 
327 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  33.43 
 
 
328 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.97 
 
 
305 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  33.33 
 
 
336 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.97 
 
 
305 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  31.1 
 
 
309 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  31.13 
 
 
331 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  31.13 
 
 
331 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  34.53 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  34.92 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  32.47 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  32.45 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.02 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  28.57 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  30.94 
 
 
386 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  33.33 
 
 
390 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  33.33 
 
 
390 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  33.33 
 
 
390 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  31.14 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  32.74 
 
 
329 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  32.74 
 
 
329 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  32.74 
 
 
329 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  34.01 
 
 
347 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.13 
 
 
432 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  30.97 
 
 
325 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.6 
 
 
333 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  31.23 
 
 
318 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.95 
 
 
354 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.52 
 
 
322 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  34.13 
 
 
339 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  31.31 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  31.31 
 
 
326 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.56 
 
 
396 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  31.99 
 
 
344 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  30.06 
 
 
319 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  31.38 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  30.27 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.63 
 
 
354 aa  136  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  30.03 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  32.46 
 
 
320 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  33.44 
 
 
345 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.11 
 
 
332 aa  135  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  32.2 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  28.86 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  29.65 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  32.81 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  30.21 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.86 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  31.74 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.67 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  34.35 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.07 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.12 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  32.78 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  30.77 
 
 
318 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  30.75 
 
 
309 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  32.25 
 
 
317 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.44 
 
 
336 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.31 
 
 
343 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  31.67 
 
 
318 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  29.45 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.51 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  30.7 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  31.89 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.93 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  29.77 
 
 
319 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  29.77 
 
 
319 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  30.13 
 
 
327 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.46 
 
 
362 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  29.77 
 
 
319 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.28 
 
 
329 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  29.77 
 
 
319 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>