More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0783 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0783  moxR protein  100 
 
 
339 aa  678    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  60.96 
 
 
342 aa  418  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  58.63 
 
 
340 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  58.81 
 
 
338 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  58.63 
 
 
343 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.63 
 
 
343 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.23 
 
 
343 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  60.06 
 
 
339 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  58.41 
 
 
339 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  56.34 
 
 
339 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  60.06 
 
 
356 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  56.76 
 
 
339 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  56.34 
 
 
339 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  54.95 
 
 
343 aa  381  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.63 
 
 
343 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.59 
 
 
345 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  55.49 
 
 
339 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  52.21 
 
 
339 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.57 
 
 
339 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  57.1 
 
 
334 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  34.32 
 
 
318 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  34.8 
 
 
320 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  33.65 
 
 
333 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.32 
 
 
341 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.23 
 
 
319 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.47 
 
 
318 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.62 
 
 
305 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  32.02 
 
 
327 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  32.95 
 
 
326 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  32.25 
 
 
327 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  32.22 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  33.66 
 
 
321 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.38 
 
 
387 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  31.73 
 
 
340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.17 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.34 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  35.26 
 
 
322 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.1 
 
 
324 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  33.99 
 
 
318 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  35.59 
 
 
326 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  31.1 
 
 
314 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  32.54 
 
 
319 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  30.65 
 
 
325 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  35.59 
 
 
326 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.63 
 
 
330 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  35.55 
 
 
319 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  34.65 
 
 
329 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  33.64 
 
 
321 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  33.67 
 
 
318 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  32.46 
 
 
308 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.59 
 
 
325 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 
354 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.84 
 
 
321 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.58 
 
 
322 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  30.06 
 
 
309 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  35.76 
 
 
319 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  35.06 
 
 
342 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  35.76 
 
 
319 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  36.42 
 
 
319 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  34.12 
 
 
327 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  35.76 
 
 
319 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  37.29 
 
 
324 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  31.41 
 
 
331 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  35.43 
 
 
319 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  36.24 
 
 
319 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  31.69 
 
 
331 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.15 
 
 
356 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  36.09 
 
 
319 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  35.43 
 
 
319 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.03 
 
 
378 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  29.17 
 
 
315 aa  142  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  33.56 
 
 
318 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  33.82 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  32.63 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  32.12 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.58 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  32.03 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  34.31 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  28.62 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  29.82 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  31.08 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  32.44 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.73 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.74 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.77 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.33 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  33.56 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  34.13 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.36 
 
 
327 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.79 
 
 
350 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  28.78 
 
 
318 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  33.33 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  33.33 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  33.01 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  30.22 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  33.33 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  31.1 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  33.44 
 
 
318 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  29.48 
 
 
326 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>