29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0050 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  43.03 
 
 		 193 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  37.75 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  40.4 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  40.87 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  40.19 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  37.67 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  41.88 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  42.67 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  35.66 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  40.12 
 
 		 448 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  40.78 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  37.16 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  38.93 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  35.35 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  32.8 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  42.38 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  36.59 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  36.19 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  50.57 
 
 		 519 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  34.59 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  33.11 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  33.11 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  31.65 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>