221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2926 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2926  putative cobalamin biosynthesis protein  100 
 
 
240 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0694  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.59 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210241  hitchhiker  0.0000263723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.89 
 
 
262 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.11 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.33 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  28.39 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.22 
 
 
626 aa  82.4  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.83 
 
 
269 aa  82  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.31 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.33 
 
 
626 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.39 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.58 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.89 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  25.94 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.31 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  25.71 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  23.74 
 
 
614 aa  69.7  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.58 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.96 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.89 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  25.31 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.61 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.93 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.18 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  25 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.78 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.21 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.89 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.39 
 
 
610 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.07 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.32 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1737  precorrin-4 C11-methyltransferase region  24.07 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.489626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.29 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.29 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.93 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  25 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.43 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.69 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.01 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.53 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.65 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.19 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.55 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  24.47 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.36 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.96 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.72 
 
 
261 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.09 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.85 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.31 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.37 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.5 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.46 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1623  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.1 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.76 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.12 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.84 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.75 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.22 
 
 
305 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.22 
 
 
473 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.13 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.51 
 
 
257 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  20.56 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.57 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.75 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.75 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.03 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.03 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.28 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.5 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.03 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.78 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  22 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  22 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1440  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  28.08 
 
 
215 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.294168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.74 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.84 
 
 
249 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  20.87 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  20.87 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  19.83 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17680  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.28 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00107277  normal  0.918127 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.46 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.13 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.5 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.59 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  20.57 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  23.48 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.34 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.15 
 
 
351 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0625  precorrin-4 C11-methyltransferase  20.68 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  22.77 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  20.79 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.06 
 
 
958 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.08 
 
 
292 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1843  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.77 
 
 
451 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.572708  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.73 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.31 
 
 
249 aa  52  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1944  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.91 
 
 
254 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  27.43 
 
 
254 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  20.78 
 
 
251 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>