More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1944 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1944  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0595  uroporphyrin-III C-methyltransferase  99.21 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  92.52 
 
 		 257 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.84 
 
 		 461 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  62.61 
 
 		 473 aa  295  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1756  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.75 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.59 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.16 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3547  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.5 
 
 		 485 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.00205228  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 		 485 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.62 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3223  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.08 
 
 		 485 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.52 
 
 		 478 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  45.69 
 
 		 401 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.22 
 
 		 478 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3024  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 		 505 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.7 
 
 		 490 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.92 
 
 		 475 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.91 
 
 		 502 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.04 
 
 		 510 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.94 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.848441  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  39.48 
 
 		 457 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  39.48 
 
 		 457 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  43.72 
 
 		 474 aa  168  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  38.98 
 
 		 457 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.38 
 
 		 479 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2151  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.75 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  44.4 
 
 		 477 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.34 
 
 		 507 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  43.48 
 
 		 485 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  41.81 
 
 		 465 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.55 
 
 		 506 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.41 
 
 		 283 aa  165  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.45 
 
 		 521 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.1 
 
 		 484 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  44.4 
 
 		 478 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  39.48 
 
 		 473 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  39.48 
 
 		 459 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  39.48 
 
 		 473 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  39.48 
 
 		 470 aa  165  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  39.06 
 
 		 457 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  39.06 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  41.74 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  39.06 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  39.06 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  39.06 
 
 		 457 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  41.38 
 
 		 465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.38 
 
 		 462 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  40.68 
 
 		 464 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.45 
 
 		 464 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.32 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.57 
 
 		 473 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3750  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.63 
 
 		 497 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592413  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  39.06 
 
 		 459 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 		 463 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2314  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.37 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.02 
 
 		 480 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 		 482 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 		 463 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.06 
 
 		 464 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.67 
 
 		 478 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 		 490 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.83 
 
 		 479 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2138  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.54 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.82 
 
 		 489 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.17 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  38.78 
 
 		 468 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.79 
 
 		 273 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.77 
 
 		 480 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.34 
 
 		 480 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.57 
 
 		 464 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  39.47 
 
 		 472 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4060  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.44 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  39.74 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  40.26 
 
 		 462 aa  155  5.0000000000000005e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00765  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.74 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  40.57 
 
 		 493 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1933  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.26 
 
 		 499 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.287576  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 		 472 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.57 
 
 		 463 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.61 
 
 		 476 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.48 
 
 		 478 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.63 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.87 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.78 
 
 		 482 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.59 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0452  uroporphyrinogen-III methylase  46.26 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0487  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  46.26 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.36 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.89 
 
 		 493 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2765  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.33 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.12287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>