More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0452 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0487  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  100 
 
 
481 aa  946    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0279715  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0452  uroporphyrinogen-III methylase  100 
 
 
481 aa  946    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2151  uroporphyrin-III C-methyltransferase  80.74 
 
 
258 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2765  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  77.78 
 
 
251 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.12287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2213  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  69.27 
 
 
227 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0138908  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  61.79 
 
 
216 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  63.08 
 
 
217 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2617  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  62.39 
 
 
237 aa  257  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  63.81 
 
 
216 aa  256  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  61.79 
 
 
216 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  59.91 
 
 
216 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1233  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  61.43 
 
 
216 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2149  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  60.19 
 
 
230 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0566543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47750  hypothetical protein  60.56 
 
 
218 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327948  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2763  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.62 
 
 
228 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0692468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  56.56 
 
 
279 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4116  hypothetical protein  60.56 
 
 
218 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2554  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  61.57 
 
 
225 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  60 
 
 
216 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.91 
 
 
275 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.37 
 
 
276 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1674  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.52 
 
 
216 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505053  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2803  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  54.77 
 
 
235 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.662243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  55.92 
 
 
279 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  58.72 
 
 
219 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.91 
 
 
215 aa  240  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.63 
 
 
464 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  58.26 
 
 
223 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  54.77 
 
 
474 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.62 
 
 
247 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.62 
 
 
247 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  60.09 
 
 
411 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  60.09 
 
 
394 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.98 
 
 
502 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.62 
 
 
247 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.36 
 
 
272 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1273  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  60.48 
 
 
216 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192281  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  53.72 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  54.13 
 
 
465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  53.63 
 
 
464 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  54.13 
 
 
465 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  60.09 
 
 
351 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  53.63 
 
 
464 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.92 
 
 
288 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  59.35 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.63 
 
 
481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1544  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  59.19 
 
 
253 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233491  normal  0.110997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  60.09 
 
 
219 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  60.09 
 
 
219 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  53.53 
 
 
462 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  60.09 
 
 
219 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.16 
 
 
277 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.18 
 
 
473 aa  233  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  58.06 
 
 
240 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.39 
 
 
479 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  57.35 
 
 
249 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.74 
 
 
277 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  57.67 
 
 
221 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.88 
 
 
263 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
292 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  50.2 
 
 
457 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  50.2 
 
 
457 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2314  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.78 
 
 
290 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  57.82 
 
 
249 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  50.84 
 
 
459 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  50.2 
 
 
457 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.2 
 
 
457 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  50.2 
 
 
457 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  50.2 
 
 
457 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  50.2 
 
 
457 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.39 
 
 
479 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  50.2 
 
 
457 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  50.2 
 
 
457 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  58.69 
 
 
248 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  50.21 
 
 
462 aa  230  5e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.79 
 
 
283 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.42 
 
 
282 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  55.66 
 
 
218 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.64 
 
 
463 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  49.79 
 
 
489 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.64 
 
 
463 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.46 
 
 
464 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  48.09 
 
 
493 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  50 
 
 
459 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.94 
 
 
464 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.24 
 
 
482 aa  226  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
480 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.83 
 
 
286 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  50.84 
 
 
470 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  57.42 
 
 
231 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  50.84 
 
 
473 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  50.84 
 
 
473 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.23 
 
 
463 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.23 
 
 
271 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.14 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1262  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56 
 
 
284 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  46.94 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  46.53 
 
 
275 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.81 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>