More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0462 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 313 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  60.73 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  60.73 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  60.73 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  60.4 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  60.4 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  60.73 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  61.06 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  61.06 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  60.73 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  60.07 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  59.54 
 
 		 302 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  62.86 
 
 		 301 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  57.43 
 
 		 301 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  57.43 
 
 		 301 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  58.42 
 
 		 301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  54.14 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 303 aa  325  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.3 
 
 		 306 aa  276  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  47.97 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  47.97 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  47.64 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  44.7 
 
 		 316 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 316 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 316 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 316 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  41.64 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  43.37 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  44.08 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  43.38 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  42.49 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  41.83 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  41.85 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  45.24 
 
 		 305 aa  248  9e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  41.78 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  39.47 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  40.91 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  43.62 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  41.5 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  41.18 
 
 		 301 aa  242  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  42.47 
 
 		 318 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1605  ornithine carbamoyltransferase  42 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.416404 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  41.67 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  41.47 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  41.75 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  41.45 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  41.31 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  42.35 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  45.22 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  41.18 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  43.33 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  41.04 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  41.04 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  40.59 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  40.33 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  44.61 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  41.04 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  40.63 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  40.74 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  39.8 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  39.8 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  42.02 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  41.75 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  41.69 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  42.47 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  39.87 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  40.66 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  39.8 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30514  predicted protein  41.43 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  40.52 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  39.74 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1248  ornithine carbamoyltransferase  42.26 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  41.29 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  41.8 
 
 		 335 aa  225  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  36.3 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  38.89 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  38.16 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  38.89 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  38.16 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>