More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2395 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2395  putative penicillin-binding protein  100 
 
 		 1023 aa  2075    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2107  penicillin-binding protein dimerisation domain-contain protein  96.49 
 
 		 1025 aa  1969    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.54 
 
 		 761 aa  353  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 		 703 aa  220  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1315  penicillin-binding protein transpeptidase  30.1 
 
 		 1150 aa  211  7e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  28.85 
 
 		 697 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  29.11 
 
 		 709 aa  197  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  26.62 
 
 		 701 aa  183  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  26.33 
 
 		 700 aa  147  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 658 aa  145  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  27.82 
 
 		 655 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.16 
 
 		 646 aa  144  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  24.69 
 
 		 689 aa  143  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  26.02 
 
 		 626 aa  134  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2372  penicillin-binding protein transpeptidase  31.67 
 
 		 949 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  28.39 
 
 		 627 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 		 642 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  27.63 
 
 		 661 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 		 630 aa  132  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 640 aa  132  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 		 703 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  27.31 
 
 		 645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.46 
 
 		 647 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 		 646 aa  129  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  29.24 
 
 		 646 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.03 
 
 		 639 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  27.62 
 
 		 618 aa  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 635 aa  125  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 683 aa  125  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 		 671 aa  124  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  25.85 
 
 		 631 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  27.42 
 
 		 655 aa  124  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 673 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  27.69 
 
 		 630 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  25.27 
 
 		 684 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 		 615 aa  123  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  25.27 
 
 		 684 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  27.62 
 
 		 618 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  26.12 
 
 		 682 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 		 691 aa  122  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.69 
 
 		 618 aa  122  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  27.68 
 
 		 636 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  25.93 
 
 		 629 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 		 631 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  29.27 
 
 		 618 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  25.93 
 
 		 629 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 		 631 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  26.65 
 
 		 629 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  26.57 
 
 		 630 aa  121  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  29.53 
 
 		 635 aa  121  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 		 618 aa  121  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 		 618 aa  121  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  25.55 
 
 		 629 aa  121  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  27.15 
 
 		 667 aa  121  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  27.15 
 
 		 631 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  27.25 
 
 		 618 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 		 618 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  27.46 
 
 		 612 aa  120  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  27.88 
 
 		 618 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 		 618 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  27.88 
 
 		 618 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  26.82 
 
 		 632 aa  119  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  25.25 
 
 		 646 aa  119  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 650 aa  119  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 		 648 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 		 648 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 		 643 aa  118  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  27.49 
 
 		 618 aa  118  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  25.92 
 
 		 629 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 640 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  27.69 
 
 		 625 aa  117  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  26.26 
 
 		 629 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  28.42 
 
 		 648 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  26.88 
 
 		 615 aa  116  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 		 610 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  27.69 
 
 		 596 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  26.55 
 
 		 605 aa  115  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  28.15 
 
 		 636 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  27.38 
 
 		 643 aa  116  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  26.63 
 
 		 619 aa  115  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.09 
 
 		 637 aa  115  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  27.38 
 
 		 613 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  26.14 
 
 		 648 aa  114  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  27.69 
 
 		 618 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  27.85 
 
 		 632 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  38.04 
 
 		 625 aa  114  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  25.1 
 
 		 647 aa  114  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  27.88 
 
 		 638 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 		 634 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  28.29 
 
 		 646 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 		 679 aa  114  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  26.88 
 
 		 681 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 646 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  24.73 
 
 		 607 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  27.61 
 
 		 618 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  28.35 
 
 		 600 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  25.85 
 
 		 602 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  24.76 
 
 		 808 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  30.51 
 
 		 655 aa  111  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>