47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02300 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ02300  structural molecule, putative  100 
 
 		 1433 aa  2915    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.781693  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06257  Protein transport protein sec31 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZM3]  39.46 
 
 		 1282 aa  357  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0130265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  38.59 
 
 		 1244 aa  327  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  36.95 
 
 		 1077 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  25.13 
 
 		 1133 aa  165  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1474 aa  59.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1807 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  25.33 
 
 		 501 aa  56.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  25 
 
 		 489 aa  57  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  24.22 
 
 		 432 aa  56.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.82 
 
 		 1831 aa  53.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  22.56 
 
 		 541 aa  53.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.18 
 
 		 596 aa  51.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  21.52 
 
 		 466 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  24.43 
 
 		 435 aa  50.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.31 
 
 		 1599 aa  50.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 316 aa  50.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  23.04 
 
 		 928 aa  50.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  32.39 
 
 		 656 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  22.22 
 
 		 441 aa  50.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47485  chromatin assembly complex, subunit 3  19.33 
 
 		 429 aa  49.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884795  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 712 aa  49.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  26.28 
 
 		 402 aa  49.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.26 
 
 		 1357 aa  48.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 		 947 aa  48.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.41 
 
 		 1205 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.19 
 
 		 1901 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.27 
 
 		 1443 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1209 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.9 
 
 		 696 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.81 
 
 		 1652 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.4 
 
 		 1193 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01695  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G08530)  24.88 
 
 		 609 aa  46.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.416154  normal  0.0260007 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  22.79 
 
 		 333 aa  46.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  27.44 
 
 		 334 aa  46.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.64 
 
 		 1217 aa  45.8  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.5 
 
 		 682 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00210  serine/threonine kinase receptor associated protein, putative  24.12 
 
 		 367 aa  46.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00228942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 1221 aa  45.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00814  cell division cycle protein Cdc20, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14730)  21.7 
 
 		 618 aa  45.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  22.35 
 
 		 567 aa  45.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1211 aa  45.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  22.79 
 
 		 317 aa  45.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.14 
 
 		 344 aa  45.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.86 
 
 		 792 aa  45.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 		 676 aa  45.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>