More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02250 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC02250  hydroxymethylbilane synthase, putative  100 
 
 		 481 aa  986    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47071  predicted protein  42.41 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454401  hitchhiker  0.00245237 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00121  hydroxymethylbilane synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11760)  45.49 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  42.66 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  42.66 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 320 aa  213  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 315 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  41.36 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  42.32 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 322 aa  210  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  42.2 
 
 		 315 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  42.25 
 
 		 320 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  42.2 
 
 		 316 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  42.2 
 
 		 316 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  41.13 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 317 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 316 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  41.13 
 
 		 316 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  40.71 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 317 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  37.32 
 
 		 310 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  39.51 
 
 		 309 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  38.11 
 
 		 310 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  38.3 
 
 		 309 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 309 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  39.35 
 
 		 308 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  37.5 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  32.46 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  36.22 
 
 		 310 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 310 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 309 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  39.44 
 
 		 306 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 318 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 313 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 313 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  36.71 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  36.97 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  37.19 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  37.15 
 
 		 309 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 315 aa  167  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  36.71 
 
 		 309 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  39.31 
 
 		 322 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  36.71 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  36.71 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  36.71 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  35.9 
 
 		 310 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  35.9 
 
 		 310 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  35.9 
 
 		 310 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 313 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  38.63 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  35.9 
 
 		 310 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  36.71 
 
 		 310 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 313 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 313 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  37.06 
 
 		 326 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  36.81 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  37.98 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 320 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 320 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 320 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  38.65 
 
 		 313 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 320 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 320 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  36.81 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  38.27 
 
 		 317 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  37.72 
 
 		 300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  37.98 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  37.28 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  162  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  35.84 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  37.15 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  37.98 
 
 		 309 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  37.28 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 334 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  160  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  37.98 
 
 		 339 aa  160  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  38.35 
 
 		 309 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  37.37 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  36.97 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  36.73 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  37.02 
 
 		 321 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  41.08 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  36.9 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  36.27 
 
 		 320 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>