More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01410 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  75.93 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  68 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  66.35 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  62.93 
 
 		 115 aa  139  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  40 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  38.24 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  38.24 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  37.25 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  36 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  39 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  39 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  36.73 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  34 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  36.36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  37.25 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  35 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  32.29 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  36.73 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  35.71 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  43.24 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  35.71 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  43.24 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  34.69 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  35.35 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  32.99 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  33.67 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  35.05 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2775  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0390875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  35.05 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  35.05 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  35.05 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0488  30S ribosomal protein S10  34.02 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.149423  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0033  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0058  30S ribosomal protein S10  32.32 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2327  30S ribosomal protein S10  32.32 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000187948  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2236  30S ribosomal protein S10  29.31 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000196356  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  33 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0083  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000583291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  31.88 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  31 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  31.37 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  31 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1876  30S ribosomal protein S10  30.3 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.000570369  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2082  30S ribosomal protein S10  30.3 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000364136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0002  30S ribosomal protein S10  30.3 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000572155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  33.67 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0191  ribosomal protein S10  33.68 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0285  30S ribosomal protein S10  32.32 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00476788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  33.67 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0766  30S ribosomal protein S10  32.99 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000754172  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  33.66 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  32 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04522  30S ribosomal protein S10  31 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000034971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  32 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  32.65 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  32.65 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  32.65 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  32 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  33.67 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  33.66 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  32.65 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  32 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  32 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  33.67 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  32.67 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1969  ribosomal protein S10  30.3 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  32.65 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  31.31 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  32 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1855  30S ribosomal protein S10  29.25 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000106721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  30.19 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  30.61 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  30.61 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3996  ribosomal protein S10  32.99 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  30.61 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0292  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0377689  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  32.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>