153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1678 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1678  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 
246 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.244515  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  46.58 
 
 
240 aa  231  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.31 
 
 
240 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  34.58 
 
 
265 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  35.62 
 
 
245 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  36.78 
 
 
270 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  36.78 
 
 
270 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  29.77 
 
 
242 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.35 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.69 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  23.83 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  25.21 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  24.89 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  23.66 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  21.55 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  24.89 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  24.03 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.55 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  21.6 
 
 
200 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  21.13 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  26.18 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  22.36 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.89 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  21.03 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  23.5 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.45 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  20.56 
 
 
199 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  23.18 
 
 
200 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  22.59 
 
 
204 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  21.86 
 
 
202 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  23.29 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  21.79 
 
 
199 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  21.85 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  21.46 
 
 
199 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  24.55 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  22.88 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.15 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  25.1 
 
 
218 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  20.82 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.1 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  26.32 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  22.51 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  20.28 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  23.53 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  24.61 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  19.75 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  25.12 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  23.65 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  23.65 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  23.27 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  23.31 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  22.51 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  44.9 
 
 
224 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.85 
 
 
227 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.85 
 
 
227 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  22.94 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  22.13 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  21.99 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  23.61 
 
 
196 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  37.04 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  22.51 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  22.88 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  25.57 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.33 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  32.05 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  23.24 
 
 
217 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  23.24 
 
 
217 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  24.79 
 
 
217 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  23.24 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  25 
 
 
201 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30.59 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  45.1 
 
 
239 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  35.8 
 
 
226 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  23.24 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.07 
 
 
174 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  23.95 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  21.28 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  22.81 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  23.24 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  21.99 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  23.75 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  35.8 
 
 
194 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  21.52 
 
 
202 aa  46.6  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  28.4 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  22.36 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  19.48 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  23.24 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.31 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  23.24 
 
 
212 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  22.13 
 
 
201 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  20.47 
 
 
211 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  23.77 
 
 
209 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  24.17 
 
 
201 aa  45.4  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>