More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1579 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  100 
 
 		 164 aa  343  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  58.71 
 
 		 206 aa  207  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  55.77 
 
 		 194 aa  191  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  49.03 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2187  glutathione peroxidase  51.66 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.836515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  48.41 
 
 		 177 aa  154  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  47.17 
 
 		 170 aa  153  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  52.9 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  46.79 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  47.95 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  47.44 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  47.77 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  47.26 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  44.22 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  44.74 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  46.1 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  49.09 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  46.62 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  43.59 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  45.95 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  47.59 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  46 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  44.74 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  45.89 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 204 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  44.23 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  42.21 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  45.06 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  53.68 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  45.39 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  42.41 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  47.1 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  43.42 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  47.86 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  43.04 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  51.72 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  44.59 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  44.59 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  42.41 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  47.3 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  45.95 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  41.95 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  41.89 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  41.89 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>