156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0357 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  62.39 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  58.9 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  54.63 
 
 		 217 aa  241  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2597  phosphatidylserine decarboxylase  56.81 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3556  phosphatidylserine decarboxylase  55.96 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  54.21 
 
 		 216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07916  putative phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  52.09 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  56.74 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_002950  PG0965  phosphatidylserine decarboxylase  44.55 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.196296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  42.53 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  42.53 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  36.77 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  39.45 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  40.36 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  42.29 
 
 		 194 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  40.64 
 
 		 247 aa  154  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  42.86 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  36.57 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  40.23 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  39.37 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  40.23 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  40.8 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  41.4 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  39.46 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.84 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  43.68 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  40.23 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  40.23 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  40.23 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  39.73 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  40.28 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  38.36 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.51 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  35.94 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  34.84 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  34.84 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.01 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  39.27 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  37.9 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  36.04 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  43.79 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  38.81 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.79 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.71 
 
 		 237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  38.99 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.36 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.36 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  34.56 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.29 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  36.77 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.29 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.05 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  41.95 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.32 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  42.2 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  33.48 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  36.53 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.5 
 
 		 237 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.16 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  35.29 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  40.62 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  38.64 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  39.08 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  42.94 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  41.46 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0895  phosphatidylserine decarboxylase  42.94 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  38.55 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  39.08 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  40.85 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  39.36 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  39.05 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  40.11 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  40.85 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  39.64 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.71 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  34.7 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  36.79 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  38.01 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  38.01 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  40.12 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  35.58 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  35.68 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>