More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1069 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  70 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  70.75 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  62.15 
 
 		 257 aa  324  9e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  62.15 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  61.35 
 
 		 257 aa  322  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  65.97 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  60.62 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  56.75 
 
 		 262 aa  288  8e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  56.75 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  56.75 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  55 
 
 		 259 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  53.26 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  55.51 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  55.51 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  57.96 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  52.09 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  57.14 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  57.14 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  58.82 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  56.33 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  58.82 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  58.47 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  58.4 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  56.05 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  53.61 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  50.19 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  56.72 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.51 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  54.37 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  55.46 
 
 		 256 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  56.78 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  53.97 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  50.19 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  52.89 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  53.99 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  50.19 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  50.79 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  50.39 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  50.39 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  49.43 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  53.36 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  51.68 
 
 		 266 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  48.66 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  50.76 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  55.1 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  52.52 
 
 		 261 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  52.52 
 
 		 261 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  54.32 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  48.66 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  54.29 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  50.99 
 
 		 276 aa  244  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  53.36 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  49.44 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  49.38 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  48.74 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.74 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  51.68 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  50.4 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  47.72 
 
 		 265 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50.63 
 
 		 278 aa  234  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  46.74 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  46.69 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  46.69 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  46.77 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  46.01 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  46.9 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.63 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  44.11 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  44.11 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  45.71 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  46.01 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  44.81 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  44.79 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.45 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  47.46 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  44.44 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  44.44 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.44 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  44.44 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  45.56 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  46.39 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.81 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  43.51 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  46.01 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  46.07 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  45.45 
 
 		 268 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  45.69 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  45.69 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  46.18 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  45.87 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  44.04 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.81 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.07 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>