More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0689 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 		 569 aa  767    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 569 aa  812    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 565 aa  782    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 		 569 aa  810    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 		 567 aa  764    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  70.14 
 
 		 567 aa  819    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  68.73 
 
 		 566 aa  788    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  69.43 
 
 		 569 aa  816    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 567 aa  1159    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 567 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 564 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 566 aa  518  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 572 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 570 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 573 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 573 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  46.17 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 580 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2311  prolyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 604 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 572 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 566 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 580 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0325  prolyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 574 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 572 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 572 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 574 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 578 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 578 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 578 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 577 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 578 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0842  prolyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 572 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0422882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2651  prolyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 574 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 578 aa  485  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 578 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0163  prolyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 597 aa  487  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 574 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 578 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1959  prolyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 600 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 584 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 571 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 569 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 574 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 568 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 574 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>