63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0318 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  61.61 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  58.55 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  54.59 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  52.17 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  47.41 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  36.48 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  24.3 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 319 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 333 aa  52  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 274 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 		 407 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 299 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  23.15 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.71 
 
 		 359 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  23.85 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 277 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  30.68 
 
 		 316 aa  45.1  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 		 310 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  24.38 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  34.09 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  25.57 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  32.89 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  36.54 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  24.43 
 
 		 369 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  39.62 
 
 		 369 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 		 316 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 336 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  38 
 
 		 355 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 331 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 331 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 331 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 310 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 		 304 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 285 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  21.79 
 
 		 254 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  22.96 
 
 		 292 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>