More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1453 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  100 
 
 
361 aa  738    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  71.31 
 
 
360 aa  546  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.74 
 
 
382 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.42 
 
 
375 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.73 
 
 
343 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.3 
 
 
392 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.51 
 
 
376 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.77 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.78 
 
 
381 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.42 
 
 
359 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  35.05 
 
 
375 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.6 
 
 
371 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.75 
 
 
356 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.59 
 
 
358 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  33.15 
 
 
334 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.42 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.44 
 
 
359 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.9 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33.16 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  30.3 
 
 
391 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.74 
 
 
357 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  32.47 
 
 
404 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33.14 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  31.2 
 
 
404 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  31.47 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  29.92 
 
 
414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  30.62 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  29.79 
 
 
429 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  29.07 
 
 
419 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.36 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  29.61 
 
 
399 aa  136  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  30.24 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  28.65 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  29.53 
 
 
401 aa  135  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  32.72 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  32.82 
 
 
403 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  29.37 
 
 
408 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  32.28 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  30.22 
 
 
373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  28.98 
 
 
414 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  27.18 
 
 
441 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  31.17 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  27.89 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  32.16 
 
 
432 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  31.91 
 
 
403 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  27.73 
 
 
416 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  27.47 
 
 
416 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  26.39 
 
 
418 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  33.69 
 
 
347 aa  126  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  27.11 
 
 
437 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  27.97 
 
 
430 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  29.32 
 
 
394 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  26.55 
 
 
428 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  29.19 
 
 
405 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  27.11 
 
 
454 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  26.65 
 
 
434 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  31.45 
 
 
360 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  32.51 
 
 
348 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  27.2 
 
 
408 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  28.05 
 
 
432 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  28.05 
 
 
432 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  28 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  26.51 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  29.41 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  28.05 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  33.85 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  27.95 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  28.04 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  29.27 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  32.39 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  28.99 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.72 
 
 
404 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  29.11 
 
 
408 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  27.13 
 
 
419 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  33.23 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  32.3 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  33.23 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  26.81 
 
 
418 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  27.85 
 
 
421 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  33.23 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  33.23 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  33.23 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.02 
 
 
349 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  33.23 
 
 
352 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  32.93 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  31.99 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  28.31 
 
 
426 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  31.13 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  33.54 
 
 
352 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  29.82 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  28.96 
 
 
421 aa  115  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  29.82 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  32.93 
 
 
352 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  30.19 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  32.52 
 
 
352 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  31.45 
 
 
359 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  28.72 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  31.78 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  29.82 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  31.66 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>