254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13318 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  807    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  58.89 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  55.84 
 
 		 385 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  55.18 
 
 		 395 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  57.53 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  54.29 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  46.47 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  45.81 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  43.55 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  43.45 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  43.1 
 
 		 425 aa  362  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  44.47 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  44.58 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  44.58 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  45.81 
 
 		 417 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  44.08 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  45.55 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  44.36 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  45.26 
 
 		 459 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  44.22 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  43.96 
 
 		 419 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  44.3 
 
 		 418 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  41.22 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  41.49 
 
 		 723 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  41.56 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  40.59 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  41.13 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  42.21 
 
 		 430 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  42.86 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  41.93 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  45.03 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  40.8 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  42.31 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  41.31 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  41.52 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  43.19 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  40.29 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  42.57 
 
 		 455 aa  332  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  43.46 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  40.64 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  41.15 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  40.92 
 
 		 432 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  42.75 
 
 		 393 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  39.85 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  38.26 
 
 		 437 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  42.09 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  42.23 
 
 		 433 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  42.93 
 
 		 420 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  41.02 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  39.16 
 
 		 423 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  41.73 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  40.76 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  42.2 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  42.13 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  41.75 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  41.75 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  42.46 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  39.24 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  42.2 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  40.76 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  39.14 
 
 		 453 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  40.95 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  39.61 
 
 		 438 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  41.54 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  41.25 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  41.12 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  40.79 
 
 		 428 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  37.56 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  40.41 
 
 		 383 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  37.58 
 
 		 470 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  39.75 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  39.76 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  39.8 
 
 		 407 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  40.6 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  37.02 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  40.35 
 
 		 408 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  40.35 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  37.23 
 
 		 448 aa  272  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  34.5 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  29.54 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  27.7 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  26.7 
 
 		 446 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  26.26 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  26.57 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  27.35 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  27.43 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  26.06 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  27.32 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  25.88 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  27.32 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  25.06 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  27.52 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  26.54 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  25.84 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  26.83 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.66 
 
 		 506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.86 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  27.84 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  25.71 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  26.94 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>