233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2054 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 416 aa  820    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  56.78 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  45.89 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  47.69 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  43.22 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  47.01 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  45.83 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  45.79 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  45.18 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  40.44 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  38.89 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  39.85 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  37.59 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  38.06 
 
 		 432 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  37.12 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  38.25 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  31.57 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  34.33 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  31.28 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  32.67 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  32.13 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.37 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  32.37 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  31.62 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  31.17 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 		 442 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.04 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.79 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  33.95 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  32.25 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  32.92 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  32.67 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  33.24 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  28.91 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  28.04 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30.75 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30.75 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30.75 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  27.42 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  28.7 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  33.56 
 
 		 448 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  27.98 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  30.63 
 
 		 420 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  24.56 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  28.6 
 
 		 766 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  30.46 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  29.02 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  31.93 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  31.77 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  31.13 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  30.17 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.91 
 
 		 506 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  30.53 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  29.41 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  28.29 
 
 		 819 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  28.69 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  29.97 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  29.93 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  29.26 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  30.48 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  31.25 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  30.13 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  36.89 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  35.59 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  30.38 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  30.3 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  29.98 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  25.73 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  29.09 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  30.27 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  30.75 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  36.28 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  31.63 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  28 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  27.9 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  29.73 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  37.09 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  28.35 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  29.36 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  28.99 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  38.84 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25.81 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  29.79 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  29.3 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  29.3 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  31.99 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  30.45 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  38.16 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  30.06 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  34.98 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  38.39 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  29.46 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.21 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 416 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  25.93 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>