More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10673 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4709  L-serine dehydratase 1  70.4 
 
 		 475 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2109  L-serine dehydratase 1  70.4 
 
 		 472 aa  690    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10673  L-serine dehydratase  100 
 
 		 477 aa  986    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.436502  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0239  L-serine dehydratase 1  59.07 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5758  L-serine dehydratase 1  56.93 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6242  L-serine dehydratase 1  54.74 
 
 		 482 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  49.26 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  47.07 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  46.72 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  47.11 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  46.84 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  47.07 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  45.94 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  48.95 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  46.51 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  45.34 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  49.36 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  45.34 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  45.34 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  45.42 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  46.25 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  45.34 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  46.25 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  45.3 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  45.34 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  46.25 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  46.3 
 
 		 469 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  45.34 
 
 		 455 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  45.34 
 
 		 455 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  47.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  45.42 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  46.25 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  46.25 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  45.4 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  45.34 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  45.13 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  45.2 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  44.87 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  45.13 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  46.37 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  46.22 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  45.3 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  46.3 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  47.02 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  46.33 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  46.35 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  45.13 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  44.7 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  45.82 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  46.37 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  45.78 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  46.3 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  45.18 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  44.7 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  49.25 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  45.18 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  46.33 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  45.51 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  46.81 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  46.43 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  44.75 
 
 		 455 aa  405  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  45.18 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  45.18 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  44.23 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  44.97 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  45.18 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  46.93 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  44.99 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  44.99 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  45.59 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1629  L-serine dehydratase 1  45.51 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.815804  hitchhiker  0.00237889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  45.4 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  44.44 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  45.18 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  46.3 
 
 		 458 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  42.92 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  45.71 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  45.18 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  46.37 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  48.28 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  46.38 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  45.2 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  46.72 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  45.15 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  46.4 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  45.2 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  45.15 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  45.57 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  44.73 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  45.15 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  44.33 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  45.55 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>