More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4709 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10673  L-serine dehydratase  70.25 
 
 		 477 aa  675    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.436502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4709  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 475 aa  983    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2109  L-serine dehydratase 1  74.63 
 
 		 472 aa  740    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0239  L-serine dehydratase 1  58.07 
 
 		 475 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6242  L-serine dehydratase 1  57.74 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5758  L-serine dehydratase 1  53.15 
 
 		 475 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  47.18 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  47.8 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  47.17 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  48.74 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  47.57 
 
 		 459 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  47.79 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  47.79 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  46.96 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  48.64 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  47.68 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  47.68 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  47.88 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  47.9 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  47.37 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  46.27 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  47.26 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  46.06 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  47.06 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  47.44 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  47.47 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  46.27 
 
 		 454 aa  425  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  47.55 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  45.94 
 
 		 454 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  45.94 
 
 		 454 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  45.94 
 
 		 454 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  46.5 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  47.97 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  45.94 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  48.33 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  45.74 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  46.58 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  45.94 
 
 		 454 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  45.94 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  47.33 
 
 		 464 aa  418  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  47.99 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  45.73 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  45.32 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  45.2 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  47.12 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  46.76 
 
 		 470 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  45.63 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  45.32 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  46.61 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  46.15 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  45.74 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  47.12 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  46.54 
 
 		 462 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  45.32 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  47.12 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  45.89 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  46.62 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  45.55 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  45.89 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  46.85 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  47.06 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  47.17 
 
 		 458 aa  415  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  45.89 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  45.55 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  46.7 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  46.06 
 
 		 454 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  44.26 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  45.89 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  46.27 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  45.88 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  45.89 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  47.89 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  45.55 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  45.11 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  45.34 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  45.81 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  45.51 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  46.7 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  45.51 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  46.5 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  45.73 
 
 		 454 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  45.38 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  46.69 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  44.23 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  45.51 
 
 		 454 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  49.16 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  46.88 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  46.36 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  46.33 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  46.41 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  48.22 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  47.38 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  46.12 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>