More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1149 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 499 aa  1039    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1195  L-serine dehydratase 1  60.12 
 
 		 477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1196  L-serine ammonia-lyase  59.52 
 
 		 477 aa  596  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.741628  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0518  L-serine dehydratase 1  57.29 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166535  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  56.26 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  56.69 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  57.26 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  54.97 
 
 		 457 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  56.05 
 
 		 458 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  55.7 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  54 
 
 		 475 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  55.7 
 
 		 460 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  56.66 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  56.25 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  55.2 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  55.49 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  56.54 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  55.91 
 
 		 459 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  55.7 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  55.39 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  56.54 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  56.54 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  56.02 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  56.54 
 
 		 458 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  54.64 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  54.64 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  54.32 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  52.8 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  54.12 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  56.05 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  54.43 
 
 		 458 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  54.53 
 
 		 464 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  54.6 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  53.8 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  54.47 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  53.49 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  54.76 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  53.91 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  53.28 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  53.07 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1304  L-serine dehydratase 1  52.78 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039374  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  55.18 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  56.96 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  55.18 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  54.34 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  54.43 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  54.97 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  54.55 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  54.55 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  53.07 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  53.49 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  54.12 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1886  L-serine dehydratase 1  54.03 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  52.85 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  53.81 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  53.49 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  54.12 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  53.49 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  54.97 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  53.49 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  53.49 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  52.64 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  53.49 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0322  L-serine dehydratase 1  54.12 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  52.62 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0297  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  53.7 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  53.49 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3280  L-serine dehydratase 1  54.43 
 
 		 460 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  53.49 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  52.85 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  53.7 
 
 		 458 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0654  L-serine dehydratase 1  54.56 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344045  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  52.83 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  54.12 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  52.83 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  53.28 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  52.22 
 
 		 462 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0317  L-serine dehydratase 1  53.7 
 
 		 458 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  54.07 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  53.7 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  52.2 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  53.93 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  52.41 
 
 		 529 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  52.41 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  52.41 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  51.57 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  52.62 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  52.52 
 
 		 490 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  51.75 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  53.7 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  52.43 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4911  L-serine dehydratase 1  53.49 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  52.22 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  52.43 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  52.09 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  52.72 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  52.93 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33270  L-serine ammonia-lyase  53.07 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0302  L-serine ammonia-lyase  54.85 
 
 		 462 aa  471  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  52.43 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>