47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06760 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  100 
 
 		 918 aa  1772    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  28.35 
 
 		 585 aa  112  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2050  hypothetical protein  37.91 
 
 		 427 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.27061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  33.79 
 
 		 338 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2351  hypothetical protein  36.8 
 
 		 296 aa  101  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.428025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3420  hypothetical protein  48.36 
 
 		 345 aa  99  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  36.5 
 
 		 1101 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  29.3 
 
 		 650 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 1026 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2350  hypothetical protein  37.69 
 
 		 295 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0668195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  39.84 
 
 		 317 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  35.16 
 
 		 953 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  28.06 
 
 		 513 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  28.17 
 
 		 515 aa  88.2  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  32.85 
 
 		 329 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  30.36 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  38.69 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2060  hypothetical protein  46.4 
 
 		 390 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  30.48 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  39.09 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  38.6 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  39.81 
 
 		 278 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  35.96 
 
 		 234 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  29.46 
 
 		 353 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  38.74 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  35.25 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  36.94 
 
 		 399 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  37.39 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  26.59 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  31.54 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  35.96 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  34.23 
 
 		 318 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  33.65 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1037 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  40.51 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  29.55 
 
 		 456 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1481  hypothetical protein  36.29 
 
 		 436 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  35.63 
 
 		 385 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  28.87 
 
 		 326 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  33.2 
 
 		 533 aa  55.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  39.39 
 
 		 484 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  30.23 
 
 		 827 aa  51.6  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  32.95 
 
 		 2095 aa  47.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  28.91 
 
 		 691 aa  44.7  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  34.16 
 
 		 599 aa  44.3  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>