28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0300 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  33.94 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  39.15 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  43.4 
 
 		 252 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  36.95 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  42.86 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  31.98 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  42.64 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  50.72 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  53.28 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  58.82 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  61.82 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  51.52 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  33.92 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  30.17 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  31.64 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  55.05 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  55 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  51.26 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  47.18 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  34.21 
 
 		 513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  49.11 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  45.87 
 
 		 484 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  42.42 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  44.95 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  51.76 
 
 		 515 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  39.8 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  33.65 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>