31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2510 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  33.94 
 
 
334 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  68 
 
 
324 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  61.74 
 
 
326 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  60.19 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  34.43 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  32.4 
 
 
299 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  37.61 
 
 
322 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  52.68 
 
 
278 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  29.21 
 
 
327 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  31.1 
 
 
317 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  36.59 
 
 
252 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  36.32 
 
 
234 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  33.77 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  54.29 
 
 
313 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  52.34 
 
 
287 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  51.72 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  45.31 
 
 
301 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  53.33 
 
 
329 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  34.17 
 
 
338 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  48.11 
 
 
376 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  47.37 
 
 
513 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  30.33 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  47.13 
 
 
515 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  43.24 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  48.72 
 
 
585 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  35.63 
 
 
918 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  33.53 
 
 
781 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1519  hypothetical protein  25 
 
 
1910 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.387558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  27.18 
 
 
1168 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>