29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1068 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  51.46 
 
 
234 aa  208  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  41.56 
 
 
299 aa  201  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  75 
 
 
329 aa  196  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  51.6 
 
 
322 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  52.17 
 
 
399 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  54.11 
 
 
317 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  50.95 
 
 
327 aa  185  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  54.95 
 
 
278 aa  185  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  46.15 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  68.38 
 
 
316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  71.31 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  70.97 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  79.25 
 
 
313 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  48.37 
 
 
343 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  43.4 
 
 
334 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  40.39 
 
 
318 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  39.09 
 
 
324 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  39.05 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  36.59 
 
 
385 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  45.76 
 
 
376 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  45.92 
 
 
513 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  36.88 
 
 
585 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  33.94 
 
 
484 aa  92.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  46.39 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  42.57 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  52.63 
 
 
515 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  38.6 
 
 
918 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  31.82 
 
 
781 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>