28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1063 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  60.13 
 
 
399 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  68.38 
 
 
252 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  71.43 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  73.39 
 
 
234 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  73.17 
 
 
329 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  78.18 
 
 
278 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  70.73 
 
 
301 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  77.57 
 
 
317 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  58.39 
 
 
322 aa  169  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  74.34 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  66.67 
 
 
287 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  60.87 
 
 
313 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  62.88 
 
 
310 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  72.38 
 
 
343 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  42.69 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  37.39 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  47.18 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  41.9 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  51.72 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  41.86 
 
 
376 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  37.88 
 
 
484 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  41.67 
 
 
362 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  40.65 
 
 
513 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  44.44 
 
 
585 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  46.25 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  45.68 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  26.59 
 
 
918 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>