28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3187 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  775    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  54.31 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  37.43 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  46.96 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  34.32 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  50 
 
 		 278 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  49.11 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  46.49 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  45.08 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  45.45 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  49.07 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  44.74 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  44.92 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  45.76 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  43.44 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  41.86 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  43.86 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  43.12 
 
 		 234 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  48.11 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  48.31 
 
 		 515 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  43.48 
 
 		 318 aa  96.3  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  30.06 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  45.1 
 
 		 513 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  35.81 
 
 		 299 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  30.69 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  44.44 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  38.74 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  41.03 
 
 		 585 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>