28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1061 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  607  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  50.2 
 
 
322 aa  202  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  40.53 
 
 
327 aa  199  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  44.16 
 
 
299 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  75.41 
 
 
287 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  70.59 
 
 
313 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  43.79 
 
 
399 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  42.45 
 
 
317 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  46.15 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  43.37 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  44.8 
 
 
234 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  54.34 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  71.43 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  70.73 
 
 
316 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  44.44 
 
 
343 aa  169  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  31.98 
 
 
334 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  50.75 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  47.24 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  50.41 
 
 
326 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  37.43 
 
 
376 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  45.31 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  45.9 
 
 
484 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  44.07 
 
 
513 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  49.15 
 
 
362 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  47.96 
 
 
585 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  50 
 
 
515 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  47.06 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  31.54 
 
 
918 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>