40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0716 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  46.82 
 
 
585 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  38.2 
 
 
515 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  37.28 
 
 
513 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  35.43 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  34.17 
 
 
385 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  33.79 
 
 
918 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  57.53 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  42.42 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  46.59 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  50.62 
 
 
317 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  44.83 
 
 
1037 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  50.6 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  41.12 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  36.84 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  42.57 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  38.81 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  48.19 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  44.44 
 
 
376 aa  82.4  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  48.81 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  47.5 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  34.52 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  35.78 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  26.85 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  43.48 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  49.37 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  47.06 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  38.1 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  30.33 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  45.68 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1112  hypothetical protein  34.46 
 
 
735 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  43.88 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2060  hypothetical protein  39.53 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 
1122 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 
1090 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 
1090 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 
1122 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 
1122 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 
1090 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 
1074 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>