42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4924 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1004    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  41.73 
 
 
585 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  38.81 
 
 
515 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  37.28 
 
 
338 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  30.77 
 
 
533 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  43.42 
 
 
1037 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0300  hypothetical protein  34.59 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  31.12 
 
 
399 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1057  hypothetical protein  33.91 
 
 
327 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3213  cell wall anchor protein  43.09 
 
 
362 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205572  normal  0.0928612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1066  hypothetical protein  44.35 
 
 
287 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5413  hypothetical protein  42.28 
 
 
318 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4274  hypothetical protein  45.92 
 
 
326 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1061  hypothetical protein  44.35 
 
 
301 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1067  hypothetical protein  35.05 
 
 
322 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1055  hypothetical protein  44.64 
 
 
310 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  47.12 
 
 
385 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1068  hypothetical protein  32.8 
 
 
252 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4639  hypothetical protein  42.5 
 
 
324 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3214  hypothetical protein  29.77 
 
 
484 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0127086  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  33.19 
 
 
343 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  27.5 
 
 
918 aa  97.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1060  hypothetical protein  33.79 
 
 
278 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  31.9 
 
 
299 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3187  hypothetical protein  44.64 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1058  hypothetical protein  48.96 
 
 
313 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1063  hypothetical protein  40.31 
 
 
316 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  42.72 
 
 
317 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1062  hypothetical protein  41.6 
 
 
329 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2050  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.27061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  43.08 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1112  hypothetical protein  38.51 
 
 
735 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  30.13 
 
 
689 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2060  hypothetical protein  33.54 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  31.84 
 
 
1122 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  31.84 
 
 
1122 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  31.28 
 
 
1122 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  31.84 
 
 
1074 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  31.28 
 
 
1090 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  31.28 
 
 
1090 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  31.28 
 
 
1090 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>