More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05410 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  100 
 
 
490 aa  998    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  66.81 
 
 
494 aa  656    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  48.46 
 
 
508 aa  478  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 
501 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  39.71 
 
 
501 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  39.31 
 
 
501 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  39.96 
 
 
501 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
546 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
505 aa  351  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  41.55 
 
 
488 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 
688 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
492 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  39.61 
 
 
523 aa  277  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  33.41 
 
 
586 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  37.77 
 
 
514 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
443 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
439 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
509 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
520 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
520 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
520 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  33.05 
 
 
520 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
446 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.05 
 
 
505 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  33.05 
 
 
662 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.09 
 
 
633 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
393 aa  123  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_25890  predicted protein  29.41 
 
 
825 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.422329  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
889 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
399 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
844 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  29.93 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
395 aa  116  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  29.15 
 
 
443 aa  114  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.02 
 
 
666 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  29.2 
 
 
661 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.34 
 
 
672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  25.07 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  26.8 
 
 
895 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
476 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
905 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
468 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 
1124 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.95 
 
 
664 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.59 
 
 
672 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
889 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
889 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  27.59 
 
 
672 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  28.57 
 
 
664 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
899 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  25.33 
 
 
606 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
944 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
919 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
473 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 
868 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
895 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
610 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
502 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  29.02 
 
 
501 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  25.08 
 
 
469 aa  104  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.39 
 
 
586 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 
483 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  29.05 
 
 
740 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
1231 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.05 
 
 
503 aa  99.8  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
438 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.2 
 
 
532 aa  96.7  9e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.89 
 
 
834 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  26.61 
 
 
737 aa  96.7  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.3 
 
 
980 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.49 
 
 
822 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.49 
 
 
831 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
772 aa  95.1  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  27.89 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  27.92 
 
 
475 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
885 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
443 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
438 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.69 
 
 
730 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  26.56 
 
 
726 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  28.98 
 
 
872 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  27.06 
 
 
729 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  28.34 
 
 
739 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.14 
 
 
718 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
859 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
650 aa  90.1  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  29.1 
 
 
874 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  29.1 
 
 
874 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  27.27 
 
 
749 aa  90.5  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
917 aa  90.1  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.44 
 
 
768 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.2 
 
 
712 aa  90.1  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
1118 aa  90.1  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>